重庆无人机运营合格证的办理地点是中国民用航空局及其下属的地区管理局‌。具体来说，申请人需要前往重庆地区管理局提交申请。办理流程包括以下几个步骤：

‌注册并登录民用无人驾驶航空器综合管理平台‌：首先，需要在该平台上注册并登录单位账号。如果已有账号，则可以忽略此步骤‌。

‌填写申请信息‌：在运营许可模块中，填写申请人信息、运营信息、无人机型号、风险评估信息等必填字段‌。

‌上传相关附件材料‌：包括符合局方要求的手册、无人机及运行设备的购买或租赁合同副本、劳动合同、运行风险评估报告及测试验证文件等‌。

‌提交申请‌：完成填写和上传后，点击完成并提交申请，等待相关部门审查‌。

‌审核与颁证‌：审查通过后，可以在系统中进行颁证操作，获取无人机运营合格证‌。

此外，申请人还需要准备以下材料：

‌个人身份证明‌

‌无人机相关证明文件‌

‌飞行计划和操作手册‌

‌企业法人营业执照‌

‌无人机驾驶员资质证书‌

‌无人机设备购置合同‌等‌。

完成这些步骤后，申请人即可获得民用无人驾驶航空器运营合格证，从而合法合规地运营无人机。