牡丹江市共辖10个行政区，包括4个市辖区、5个县级市、1个县。分别是东安区、阳明区、爱民区、西安区、绥芬河市、海林市、宁安市、穆棱市、东宁市、林口县。牡丹江市人民政府驻东安区卧龙街。

牡丹江机场是军民合用机场，担负国防任务和为广大市民提供安全便捷的出行条件的重要设施。为确保飞机飞行安全，牡丹江机场呼吁广大群众，严格遵守《中华人民共和国民用航空法》《民用机场管理条例》等相关法律法规，禁止在净空保护区放风筝、气球、孔明灯、无人机等，禁止在航路附近进行飞行活动、燃放高空烟花爆竹以及安装大功率探照灯，禁止在机场周边放养家鸽等行为。如确有需要进行上述行为，必须先征求牡丹江机场意见。

牡丹江市存在禁飞区，主要集中在牡丹江海浪机场周边。在现代航空管理体系中，为了确保航空安全和公共安全，相关航空管理部门会设定飞行限制区域，即俗称的“禁飞区”。这些区域的划定旨在限制无人机等非传统航空器的飞行，以规避潜在的安全风险。具体如下：

地理位置：牡丹江市的禁飞区主要围绕牡丹江海浪机场划定。机场作为重要的航空运输枢纽，其周边的空域管理尤为关键，需要严格限制其他飞行器的进入，以保障商业航班的正常起降和飞行安全。

管制措施：在这一区域内，无人机及其它类型的轻型航空器可能会受到严格的飞行限制或者完全禁止飞行。这些措施包括但不限于飞行高度限制、飞行时段控制以及飞行前的强制申报等。