无人机水库巡检需要的资质证件包括企业资质和人员资质，具体如下：

企业资质

营业执照：企业需合法注册，经营范围应明确包含无人机巡检等相关业务。

民用无人驾驶航空器运营合格证：根据《无人驾驶航空器飞行管理暂行条例》规定，企业使用除微型以外的民用无人驾驶航空器从事飞行活动，需申请该证。不过，使用最大起飞重量不超过 150 千克的农用无人驾驶航空器，在农林牧渔区域上方适飞空域内从事农林牧渔作业飞行活动，无需取得运营合格证。

无人机巡查企业服务能力等级资质证书：这是针对从事无人机巡检服务企业的资质认证，根据企业在该领域的专业能力、技术实力、服务质量等综合因素进行评定，不同等级对应不同的服务能力和水平。

人员资质

民用无人驾驶航空器操控员执照：根据规定，操控小型、中型、大型无人机进行水库巡检，操作人员需要取得 CAAC 执照。如果是在视距内飞行，需视距内驾驶员执照；若进行超视距操作，则需超视距驾驶员执照。

特种作业人员操作证：由于无人机操作具有一定危险性，部分地区或项目可能要求操作人员持有特种作业人员操作证。

其他相关要求

空域使用申请：作业执行单位应向水库途经地区的空管部门报批巡查航线计划，履行空域申请手续，向空军、民航相关部门申请航线，并接入无人机云系统，起飞前还应申请放飞许可。