贵港无人机运营合格证的办理流程如下：

登录平台：登录民用无人驾驶航空器综合管理平台（https://uom.caac.gov.cn/#/login），注册并登录单位账号（若已有账号可忽略）。

进入模块：进入运营许可模块，点击 “初始合格审定申请”。

填写信息：点击 “新建”，进入民用无人驾驶航空器运营合格证书申请界面，按要求填写带 * 号的必填字段，包括申请人信息、运营信息、无人机型号、风险评估信息、运行风险等。

上传材料：上传相关附件材料，如符合局方所要求内容的手册、民用无人驾驶航空器及运行设备设施的购买或租赁合同副本、与管理人员和民用无人驾驶航空器操控员签署的劳动合同、说明计划运行的性质和范围的文件、符合局方要求的保证持续具备按照制度、规程、手册实施安全运营能力的运行风险评估报告及测试验证文件、申请人符合相关规则所有适用条款的符合性声明等。若申请从事经营活动，还应当提交营业执照、法定代表人身份证明文件、涉及外商投资的需提供股东、实际控制人及管理团队合规性声明文件、拟申请的经营种类及相关说明材料等。

填写规范（开放类无需填写）：填写运营规范。

提交申请：填写完成后点击完成并提交申请，等待相关部门审查。审查通过后，可在系统中进行颁证操作，获取无人机运营合格证。

办理时间方面，一般情况下，中南地区（包括贵港所在的广西）办理民用无人驾驶航空器运营合格证的时间通常在 30 - 45 个工作日左右。但具体周期会因地区管理局的安排和工作量、申请材料的完整度以及申请人的具体情况等因素而有所不同。也有信息指出，如果材料齐全、审核顺利，最快三个工作日内也可能出证。