没有运营资质却开展相关业务的无人机企业，会面临严厉处罚。根据《无人驾驶航空器飞行管理暂行条例》明确规定，一旦此类违规行为被发现，民用航空管理部门首先会责令企业立即改正。与此同时，企业还将被处以罚款，罚款金额处于 5 万元以上 50 万元以下的区间。这个罚款幅度旨在对违规企业形成有力威慑，使其意识到合法合规运营的重要性。

情节严重的情况下，处罚措施会进一步升级。相关部门不仅会责令企业停业整顿，要求企业全面梳理自身运营流程，直至达到资质要求标准，甚至可能吊销其运营合格证。运营合格证作为企业合法开展无人机运营业务的关键凭证，一旦被吊销，企业将彻底失去合法经营的资格，这对企业的存续和发展无疑是沉重打击。

除了民用航空管理部门的处罚外，如果企业的无人机飞行活动同时触犯了其他法律法规，后果会更为严重。比如在飞行过程中扰乱公共秩序，致使公共场所陷入混乱，影响正常社会运转；或者危及公共安全，对人民群众的生命财产构成潜在威胁。这种情况下，公安机关等相关执法部门会介入处理，企业极有可能面临治安管理处罚，像警告、罚款、拘留等。若其行为已经达到犯罪标准，司法机关将依法追究企业及相关责任人的刑事责任，责任人可能面临有期徒刑等刑罚，企业也可能面临罚金等刑事处罚。